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满清的驻藏大臣分为驻藏办事大臣和驻藏帮办大臣，名义上为一正一副，实则互不统属，遇事掣肘。
雍正末年以前，驻藏大臣尚无统一头衔，有总理、料理、协理西藏事务等多种名号。员额初定为二员，一人卸任时，仍有一人留驻，有助于新赴任者熟悉西藏政务。然而雍正年闲，藏内局势不稳，同时派驻西藏的办事大臣、协理大臣常达四、五人之多。阿尔布巴之乱平定后，乾隆元年，减驻藏大臣为一员。但乾隆十二年颇罗鼐死后，其次子珠尔默特那木札勒作乱，驻藏大臣纪山督办不力，致使乾隆皇帝认为“藏地关系甚要，彼处应办事件有二人相商，较为有益，且换班先后更替，有一旧人，尤觉妥当。”遂于乾隆十四年恢复了驻藏大臣二员的旧制。乾隆四十五年后，驻藏办事大臣与驻藏帮办大臣始有严格区分。
驻藏大臣一般以满人、蒙古人充任，间有汉人。驻藏大臣任期为三年。雍正十年谕令曰：“嗣后驻藏大臣、章京、笔帖式皆酌量于绿营换班之期，三年一换。更替之大臣自成都带领换班官兵至藏，清查交待后，旧驻藏大臣带领原驻官兵同回内地。”然而由于路途遥远、政局变化等原因，实际任期短则数月，长则四五年。
雍正至乾隆初年，驻藏大臣仅统辖驻藏官兵，督导郡王颇罗鼐办理政务。颇罗鼐死后，珠尔默特那木扎勒与达*赖喇嘛不合，又勾结准噶尔部，阴谋叛乱，于乾隆十五年（1750年）被驻藏办事大臣傅清、帮办大臣拉布敦诱杀。随后，傅清与拉布敦又为珠尔默特那木扎勒党羽所害。叛乱平定后，四川总督策楞上奏《西藏善后章程》十三条。于当年颁行。《西藏善后章程》规定西藏之重要事务，如地方官员任免升迁、调遣兵马、防御卡隘等，由噶伦请示驻藏大臣、达*赖喇嘛酌定办理。驻当雄的达木和硕特八旗蒙古军队亦归驻藏大臣统辖。
乾隆五十八年（1793年）两广总督福康安领兵平定廓尔喀入侵后，奏请颁行《钦定藏内善后章程》二十九条。再次确定了驻藏大臣及噶厦的职权。章程规定驻藏大臣地位与达*赖、班禅平等。达*赖喇嘛、班禅额尔德尼、西藏各地大呼图克图的转世掣签，以及达*赖喇嘛坐床典礼，须由驻藏大臣主持。达*赖喇嘛等僧官不得直接上书皇帝，须由驻藏大臣转奏。各大寺庙堪布（住持）如有缺出，由驻藏大臣会同达*赖喇嘛拣选。噶伦及其下的噶厦僧俗官员均为驻藏大臣下属。噶厦办理的各项政务。须由噶伦禀告驻藏大臣及达*赖喇嘛，不得擅自隐匿。噶伦、戴琫（即代本）级别的官员出缺，由驻藏大臣与达*赖喇嘛开具候选名单上奏皇帝，由皇帝拣选任命。前后藏其余官员由驻藏大臣分别会同达*赖、班禅选补。凡西藏地方边防、驻军、通商(廓尔喀一年可到西藏一次,克什米尔三年一次)、铸币、外国朝贡等事宜，均由驻藏大臣统筹办理。驻藏大臣亦有权稽查西藏地方财政收支；并督察司法、户口、差役（乌拉）等事项。
可以说，正是从这才是，中央政府才加强了对西藏的管理的。
现任驻藏办事大臣名叫斌良，瓜尔佳氏，满洲正红旗人。驻藏帮办大臣名叫穆腾额，巴岳特氏。满清正黄旗人。两人负责管理整个西藏地区，可以说，除了黄教领袖班禅和达*赖喇嘛之外，整个西藏都在他们的控制当中。在西藏，他们就属于土皇帝。但是，现在的两人却感觉前途渺茫。原本驻藏大臣三年一换的，但现在满清都已经灭亡了，他们还能够怎么办呢？
驻藏办事大臣斌良的府邸，斌良和穆腾额两人，正愁眉苦脸。他们刚刚才确定了消息。在3月的时候，北京城已经被帝国陆军攻下，满清的皇帝和摄政王，都已经被帝国陆军给俘虏了。
“大人。你说这是个什么事啊！堂堂大清，短短几年的时间就灭亡了。我们满人的天下，这就完了？”穆腾额长吁短叹。随着满清灭亡的消息传来，他们两人的驻藏大臣的名头，也就不值钱了。原本那些对他们恭恭敬敬的藏人官员和土司们，对他们也开始阳奉阴违起来了。要不是他们手里还掌握着上万的军队的话。说不定连命都没有了。
“唉！王朝更迭，原本就是常事。只不过，现在轮到我大清了。我大清入关两百年，终究会有这么一天的。只不过，没想到这一天来的这么快。”驻藏办事大臣斌良显得有些落寞。
“大人，你说我们现在该怎么办才好？这些日子，那些土司越来越不像话了。再这样下去的话，整个高原恐怕都会乱起来的。”穆腾额有些担心的说道。
“放心吧，乱不起来。只有我们还有军队在手，那些土司就算再蹦跶，也不过是找死！他们敢乱，我们就敢杀。哪怕是杀的血流成河，也在所不惜。”斌良眼中闪过一道杀机。满清对于这些土司，向来都是剿抚并用的，对于那些反叛的土司，下手也从来都是毫不留情的。
“大人，我担心那些土司背后，有人为他们撑腰。否则的话，他们是不敢这么狂妄的。”穆腾额说道。
“哼！是班禅还是达*赖？”斌良问道。
穆腾额摇了摇头。
“难不成是中华帝国？”斌良有些诧异的问道。
“也不是他们，我的人密保，在拉萨出现了洋人，来自南面的英国人！”穆腾额说