朝廷对于自己的云南改革大计，已经颁布了圣旨，并赐予了予杀予夺的尚方宝剑，明确了云南宣抚使在云南境内拥有民事、政经、军队体制改革的无上权力，也赋予了随时任免官员，甚至生杀予夺的特权。
所以说，云南各方面改革的阻力已经基本消失，现在正是李翊大展拳脚的最佳时候。
但任何改革都应该自上而下，先从政制改起，否则的话，没有制度的保证，改革就不能深入进行下去，改革成果也固定不下来。
相对应的，改革的风险就会很大，老百姓就会产生怀疑，甚至不敢参与进来。这样一来，没有老百姓参与的改革，就不会是彻底的改革，也永远不会见到真正的成效。
所以，李翊在和林易、简铮、郑文重、钱士塘、何守杰等文武智囊通盘考虑后，决定先从云南的政制入手，以官员的职务层级和职权划分为先导，理清各级官员的职责所。
制定官员任免考核制度，完善举荐、选拔、任用制度，相应的增加一些有利于经济建设的职能部门，为经济改革提供指导和帮助，并加以严格监管，杜绝经济犯罪活动。
首先，把政制改革划分为两大系统，职权划分系统和职官品级系统。
云南辖下共计一州六县，分别是宁州、东川县、会泽县、宣县、盘县、富源县、陆良县。三关分别为白雾关、平阳关、越州卫，七个巡检司分别是富源煤矿巡检司、汤丹铜矿巡检司、胜境关巡检司、宝山关巡检司、马街巡检司、漕运巡检司，另外新设的响水坝巡检司是林锦正在建设的响水坝水库所在地。
云南宣抚使府是云南的最高行政机构，负责管理云南一州六县的民事、政事、军事、税收、商贸等所有事务。
以云南宣抚使为最高长官，下设宣抚使府主簿、都押衙、录事参军事、掌书记、六曹参军、文学博士、医学博士，以及其他主事、从事、执事人等。主簿由林易担任，品级正六品，全面负责宣抚使府的命令拟就、审核、下达，并对其他官员的考核、任免进行管理。
宣抚使府掌书记由东方荆担任，品级从七品，协助林易处理宣抚使府事务。
都押衙由郭准担任，品级正七品，全面负责宣抚使府的安全保卫工作，下辖前衙、后衙校尉、副尉，分别由连骏、勒蒙、南方、郭小双担任，品级分别为从八品和正九品，全部亲兵编制为三百六十人。
录事参军事由何守杰担任，品级正七品，全面负责六曹事务，并兼管各级官员的监察事务。
六曹参军分别为司士参军林锦，品级正八品，掌管河津、道路、桥梁、官府房舍建造、修缮事务；司功参军萧会，品级正八品，掌官员、考课、祭祀、礼乐、学校
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、选举、表疏、医筮、丧葬等事；司法参军仇封，品级正八品，掌管民事纠纷、官司、诉讼、刑狱事务；司仓参军向忠，品级正八品，掌管勋官、俸禄、仓房、马匹、器具等管理事务；司兵参军孙成业，品级正八品，掌管军队武官任免、边境防备、招纳、训练士卒、兵器制造、发放等事务；司户参军江华，品级正八品，掌管人口、户籍、赋税、营田、水利、征收归仓等事务。
文学博士袁国策，品级正八品，全面负责云南教育、教学事务，下设的云南政经堂堂正陆伯平，品级从八品，负责云南最高学府—云南政经堂的教学任务。
医学博士杨乐泉，品级正八品，全面负责云南的医药管理、防疫、防病等事务，下设云南医学馆和云南医药局，医学馆负责防病治病和防疫工作，而医药局负责药剂制作、发放、销售工作。
白雾关、平阳关、越州卫三关防御使分别为张勃、殷权、成迅，品级均为正七品，下设防御副使，品级从七品，其中平阳关防御副使为卫荆。各关防编制为，白雾关一千人，平阳关一千二百人，越州卫八百人。
另外每个关防下设中军校尉，品级从八品，负责防御使的安全保卫，人员考核、军务督查工作；警戒校尉、左军校尉、右军校尉、前锋校尉均为正九品，负责警戒、防卫、指挥作战工作；行军校尉也为正九品，负责后勤保障、军器运输、保管、分发任务。
宁州大营都指挥使由宁州马步军都指挥使简铮兼任，下设朴刀营、骑兵营、后勤营，人员编制共计一千三百六十人人。其中朴刀营和骑兵营各五百人。
后勤营指挥使由李会担任，品级从七品，人员编制三百六十人，战时可随时征集人手补充，负责辎重补给、粮草运输、军器修造补充等工作。
新设立义警营，其主官义警指挥使由原骑兵校尉赵范担任，品级正八品，负责训练乡勇、民兵，指挥、部署、协助乡里维护治安、缉捕盗贼。人员主要从各县乡抽调精壮男丁，常备兵员只有二百三十人，必要时随时可以征集。
在宣抚使府之外，由宣抚使直辖云南转运司，其主官云南转运使郑文重，品级正五品，全面负责云南的盐铁、度支、漕运、煤矿等事务，下辖漕运巡检司和煤矿巡检司，漕运巡检使由郑文重兼任，巡检副使由岳维担任，品级正八品，负责漕运安全护卫、要津防守和检查、维护工作，军卒编制三百六十人。
煤矿巡检使由已经裁撤的原平阳巡检使廉永担任，品级正八品，人员编制二百四十人。其他的四个巡检司人