王列给达芬奇出了两个选择，但是这却是没有选择的选择，不管达芬奇启动还是不启动那个武器，王列似乎都打定主意要杀掉达芬奇了。
“你是从什么时候知道这一切的？”达芬奇的脸色阴沉不定，这才是他最郁闷的事，自己以为自己做的已经很隐秘了，为什么还会被王列知道，就连那种武器都被王列知道了，这让达芬奇实在有些不明白。
也就在这个时候，一直站在另一旁的十二号突然站到了王列这一边，这就是以行动过告诉了达芬奇这一切到底是什么回事。
达芬奇一愣，突然大笑了起来：“真是可笑啊，真是可笑，也只有我还蒙在鼓里，原来这一切都是安排好的。。。”
看到十二号站在王列那一边达芬奇当然已经知道了这一切到底是怎么回事，一直到最后他还是没能摆脱自己的宿命，一切都在达玛博士的预料之中。
当年达玛博士把自己变成这种幽灵的模样的时候就已经把达芬奇的机能全部停止了，从没有想过还会重启达芬奇，所以达玛博士并没有给达芬奇设置像牛顿他们那么多的规则，也就是说达芬奇的自由度要高得多。
而当达玛博士以幽灵的形态返回到这个时间的时候就出现麻烦了，唯一能看到达玛博士就只有十二号，但是紧靠十二号显然是不可能达到达玛博士的目的的。
达玛博士想要看到一个不一样的未来，而这个未来就需要王列去铸造，也就是说需要王列变强，至少需要给予王列足以与查理争锋的实力，而这一切十二号是不可能给他的，十二号是达玛博士早期的试验品，虽然拥有很强的战斗力，但是智慧并不高，好处就是十二号对达玛博士拥有绝对的忠诚，因为在十二号模模糊糊的记忆之中达玛博士出现的次数是最多的，就像婴儿会把小时间见过最多次数的人当做最亲近的人一样，十二号对达玛博士的服从是发自内心的。
然后十二号和达玛博士去了很多地方，包括避难所之内的那个实验室幽灵形态的达玛博士也去过，他需要找到一个让王列足以与查理相抗衡的契机，光是“诺亚”恐怕还不够，王列需要一个毁灭性的武器。
达玛博士不愧是旷世奇才，很快就找到了线索，对这个最终武器有了一个整体概念，但是这个武器非常恐怖，这个武器的威力比当年造成“大灭绝”的ms机械蚊还要恐怖，一旦使用说不定就真的是世界末日，所以达玛博士虽然将其制造出来，但是却没有完全授权给达芬奇，而是掌握在自己手中。
然后达玛博士就找到了“诺亚”，指挥十二号将达芬奇启动，“诺亚”是实现“第二个未来计划”中最重要的一部分，这是让王列与查理争锋的第一步。
但是达玛博士怎么可能忽略达芬奇这个智脑？不同于牛顿他们四个智脑，达玛博士当初将原地球武装交给四个智脑的时候就已经给了他们各种各样的限制，至少无论如何都必须以“新人类计划”为中心这是绝对的。
但是达芬奇没有，变成幽灵状态的达玛博士已经没有能力给达芬奇加上各种镣铐，十二号虽然听从达玛博士的命令，但是十二号不可能有那种能力，纵使是这样，达玛博士还是讲达芬奇重新激活了，而达玛博士对达芬奇的限制也就只是口头上的一些限制，但是没有人比亲手制造出这些智脑的达玛博士更了解这些智脑。
他们拥有远胜于人类的学习能力和计算能力，而在不停的吸收外界的知识的同时他们也必定会受到一些外界不好的干扰，比如yù_wàng！
这就是栖息在人类心中最可怕的怪兽，达芬奇和牛顿他们最不同的地方就是达芬奇知道全套的“新人类计划”，他也知道达玛博士所说的“第二个未来”值得是什么。
而达芬奇伪装的很好，他现在所做的一切似乎都是为了最后的胜利，为了帮助王列，就算瞒着王列做一些事情其最终目的也是帮助王列战胜查理，似乎没有什么问题，但是只有达玛博士知道达芬奇不可能这样一直帮助王列，他会在最后阶段在背后捅王列一刀。
而达芬奇也知道达玛博士肯定明白自己的想法，所以自从达玛博士和王列进行了一次谈话之后达芬奇就想尽一切办法、用遍所有借口不让王列与达玛博士有丝毫接触，以此遮掩自己的真正目的，毕竟因为程式的原因，他是不可能真的伤害达玛博士的。
但是可惜的是终究还是功亏一篑，因为达芬奇把十二号忽略了，达芬奇可不知道十二号和达玛博士的关系，达芬奇一直以为十二号和自己这些智脑面临的问题是一样的，都想要摆脱现实的限制，但是实际上十二号和他们完全不一样，他对达玛博士是绝对效忠的，而且达玛博士也清楚的知道这一点。
往往看起来傻的人更容易被人相信，达芬奇就上了这个当，十二号只好按照达玛博士吩咐的说那么几句，达芬奇就相信了，因为十二号本身的智商太低，似乎是不会说谎的，但是结果就是十二号做了一次双面间谍。
一方面十二号似乎是站在达芬奇这一边的，但是十二号却找机会将这一切告诉王列，十二号自己当然不能表达太多东西，他是将达玛博士之前费了不少力气制造出来的记录了一些信息的磁盘交给了王列，所以王列才知道了一切，知道了达芬奇迟早的背叛。
达芬奇的确是打算好背叛王列，但是直到现在达芬奇都是在帮