在琉球群岛，日本人逐渐开始新的生活。但很快，临时首相的新闻讲话将遭逢大难，埋藏心底的怨恨、愤怒、不甘全都引爆了出来。得益于美国频频传出的在数码世界摧枯拉朽，所向无敌的消息。民众渐渐不将数码兽的威胁放在眼里，反攻本土的呼声日渐高涨。终于，临时政府适时抛出了彻底歼灭时空晶界中数码兽的方案。
然而一般人不知道的是：时空晶界，是一种将物质、资讯转化为不稳定中间态的技术，可以将物质虚化，也可以将资料实体化！因此日本本土上的数码兽和人类正处于一种介于数据态与物质态之间的状态，它们的本质构造，是相同的！
也就是说，要歼灭数码兽，也要同时歼灭掉那些待在日本本土的人类！
“就像低级格式化一样的干净！”临时首相在新闻讲话的最后说道。
大阪都。天上的阴云罕见的开始消散，然而太阳石看不见的。这里的天空和外界是不同的。这里是，时空晶界！
空灵的圣歌在教堂中飘荡，每一个虔诚信徒的头顶都弥散出金色的光焰。这里是拜女神教的教堂，这些信徒因为对女神坚定的信仰拒绝了营救人员迁往冲绳县的要求。而在背后，这些崇拜数码兽的人类信徒也同样上了临时政府的黑名单，激进派视其为“污染因子”。他们自愿留在这“罪恶之地”正称激进派的心意。
与此同时，梅克斯真理教的据点里，华原翔和他的人类同志们第一时间注意到天空的变化。
“怎么回事！？是大德拉库吸血魔兽要回来了吗？”华原翔不顾腿上的伤，急忙追问梅克斯真理教的智囊们。这段时间他一直被泉光子郎追杀，腿部受伤后，就只能躲在据点里。
“不，不是，倒像是空间本身发生了什么变化！”一名白大褂研究员留着冷汗道。
“组成空间的中间态粒子变得不安定了！”另一名研究员大声道。
“什么意思！？”华原翔意识到什么。
研究员倒退两步，面如死灰：“就是说……空间，开始崩溃了……”
“这个世界完了！”精神崩溃的“同志”们纷纷逃散。
“怎么可以！？”华原翔终于明白，是人类动手了，他们要把这块土地上的数码兽连同人类一起，消灭掉！“简直，丧心病狂！”
“我也这么觉得~”冰恶魔兽悄无声息出现在华原翔身后，“原来人类杀起自己的同类来，也是这么干脆果断！我开始喜欢这个种族了~~哈哈哈……”
华原翔被激怒了，像他这种为了正义甘愿投身黑暗的人最受不了这样的嘲弄：“不要说风凉话~！必须想办法，不然大家都要死在这里！”