然而在洲际以上的国外比赛难觅“马家军”弟子的踪影，就是参赛，也不复往日风光。更不可思议的是，“马家军”弟子在全运年后状态一落千丈，而且状态回升一定要到第二个全运年才能回升。全无当年二个月内出现二次高峰之神奇。1996年奥运会，田径管理部门万般无奈，请出马俊仁的死对头毛德镇担任闲赋在家的王军霞的教练，依靠王军霞的一金一银，勉强保住了中国田径的面子。
2000奥运，田管中心吸取了教训，早在二年前就以合同的形式要求“马家军”确保奥运金牌，并提供了相应的资金。遗憾的是，就在出发前夕，众多“马家军”弟子被国内的预测不合格挡在了悉尼的门外，唯一取得参赛资格的李季发挥了个人最高水平，也只得了个万米跑的第八名，离奖牌要求相距甚远。不久就传来了“马家军”若干弟子因服用兴奋剂被禁赛，马俊仁本人也因此受到了通报批评。其他队员出走的出走，退役的退役。
可以说，2000年是一个分水岭。从此以后，“马家军”就渐渐淡出了人们的视野。
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