完成了基础改造以后，接下来，便是将维生系统，武器系统，探测系统等星舰必须具体的功能性部件整合到这些生物体内。当然，这些系统也皆包含了生物终端，起到与生物体融为一体的作用。 像高能粒子聚能炮，卵型飞虫腐蚀弹，超极光炮，这些都是纳野星人特有的武器，这些威力强大的武器皆被整合到生物系星舰中，并形成强大的战斗力。
更为奇妙的时，生物系星舰在一定范围内会形成心灵感应的效应，达到信息共享，统一行动的目的。因此，生物系星舰在执行集群作战任务时是非常默契的，这也是生物系星舰的一大优势。
j博士与其研究团队得到这些资料信息后，简直到了欣喜若狂的地步，因为，这意味着，他们在泰元星安置下生命精元后，这里将成为他们生产生物系星舰的基地，而且纳云之母赚他们这样礼物的意义就在于此。
游天明将幸存的交智星人尽数撤离到了三才星之后，一切开始按部就班起来，虽然在交智星上的成果皆毁无一旦，但他们庞的舰船队伍，还是将一些十分重要的东西带到了三才星，此时，他们在三才星上的主要工作便是重建工作。
三才星是一颗未开化的星球，虽然环境适宜，但并未进化出智能生物，一切都处于原始状态，这无疑为他们提供了广阔的发展空间。为了不破坏三才星的自然环境，他们只在一些空旷地建立聚居区，聚居区又是半球型的能量膜围起来，形成一个独立的空间，在能量膜外围，则是一都半透的玻璃墙以阻隔三才星上的生物过入聚居区内。
同时，这两道障碍也使得交智星人不得随意进入到除聚居区以外的其他区域。 经历大毁灭灾难的种族，变得更注重保护自己的生存环境。如此这般，交智星人在三才星全球建立了10个聚居区，占地只达到三才星陆地的千分之一而已，这种布局，使得他们与三才星的自然环境和谐共相处，互不干扰。
为了让三才星免遭交智星毁灭的命运，游天明决定将警戒网扩大到方圆百光年的范围内。只要有不知名的，或是利忍先锋特有的舰船驶入这片星区，巡逻舰队将毫不留情的予以摧毁，以此保证三才星的星域坐标不被暴露出去。
而负责外围警戒任务的，正是觉明和荒智雨率领的50艘复合星舰，随后，红凌，辰轩，崔极，以及慕晓他们都加入了这支警戒队伍，他们一边负责三才星的外围警戒任务，一边打探渡宇和聂云的消息。 然而转眼半年过去了，渡宇他们依旧没有任何消息，这经过半年时间的煎熬后，这些渡宇的忠实伙伴们，几乎都快绝望了。
慕晓更是每天以泪洗面，后悔自己没能跟了渡宇同去。 不过，三才星上的事业，却是蒸蒸日上。在觉明他们的层层警戒之下，半年之内，再无利忍先锋的舰队来袭，而那些星际海盗，更是忌惮游天明如今的实力，不敢越雷池半步。 一切似乎都按部就班地进行着，他们也在渐渐积储实力，以图反击。
然而，某一天，觉明他们的舰队碰上了一艘极为奇特的飞船，这艘飞船并不是来自任何觉明他们已知的文明，但这艘飞船的先进程度，却足以惊倒他们中的任何人。而这艘奇特飞船的到来，给他们带来了一个十分意想不到的消息。