不追责名单念完后，开始念轻犯名单，共九十七人，这些人解穴后被神龙帮弟子押到广场上看押。
接下来念从犯名单，共二百七十四人，这些人解穴后也被神龙帮弟子押到广场上看押。
主犯二十一人，即鳄鱼帮帮主、东南西北四位舵主、十六位分舵主，先用一根铁链串联起来，然后解穴，押到广场看押。
剩下的是重犯三百二十人，每二十五人一组，先用铁链串联起来，共串了十三串，解穴后押到广场。
罪犯名单念完后，金光尔、种飞龙、司马天星等人全部去到广场。
金光尔宣布：“主犯、重犯全部押解进京，今夜子时登船，明日一早出发！”
“从犯二百七十四人施双刖之刑，轻犯九十七人施单刖之刑，立即执行。”
司马天星拔出腾空剑，交给神龙帮刑舵弟子行刑。
霎时间，洞庭西山上惨嚎声接二连三，此起彼伏。
刑舵弟子在前面行刑，户舵弟子在后面止血、包扎伤口。
行刑完毕后，天色已黑，司马天星命令那些未被追责的人到厨房置办饭菜。
邬单衣、朱贡祖、吴良才以及八个商人、五个家眷、被刑罚的四个鳄鱼帮帮众也被神龙帮户舵弟子从船上带到了总舵。
用罢晚饭后，司马天星与易星、种氏兄弟去到僻静处，司马天星向易星讲了下一步安排，简化了说就一个字:“拖！”，拖个二、三十天，财宝船差不多早就到了鄱阳湖和洞庭湖，鳄鱼帮受刑的人伤也差不多痊愈了，再送吴良才等人和鳄鱼帮劫后余生的所有人离开洞庭西山。
司马天星说他要离开洞庭西山一趟，大概二十天后才回来，问种氏兄弟是去是留。
种氏兄弟说他们并没有其他事，这次离开山庄的主要目的就是到江湖上历练，见司马天星等人闹腾得如此厉害，绝对是大动作、大手笔，适逢其会，兴奋莫名，怎会离开。
司马天星遂请种氏兄弟协助易星，一是将所有人控制在鳄鱼帮总舵不得离开，由户舵医者护理，安心养伤。二是免于追责的邬单衣等一百零九人要将行刑的血迹清理干净；对鳄鱼帮各驻地进行搜查，凡是财物、粮食一律搬运到总舵分类封存，登记在册；最后将鳄鱼帮所有船只全部收拢到总舵停泊妥当，登记在册。
晚上子时，金光尔、司马天星率刑舵弟子及非医者的护舵弟子共二百余人，押着一串主犯和十三串重犯前往码头登船，每船载一串人犯，共出动十四艘船。
十四艘船迤逦而行，司马天星坐在最前面一艘。
大约行了两个时辰，到了湖心，司马天星施展神视和神识之能，找到了太湖的水眼，该水眼二十丈方圆，深不可测。司马天星结手印，驭使腾空剑逐一刺进二十一名主犯的眉心，吸尽精气及神魂，然后命船上的神龙帮刑舵弟子将二十一人的尸体连带铁链全部丢进湖里，沉入水眼中。
司马天星跳到第二艘船上，第一艘船开走。他再次祭出腾空剑，吸尽二十五名重犯的精气和神魂，之后将尸体连带铁链丢进水眼中。
待第三艘进入水眼范围后，司马天星又跳到第三艘船上。
就这样，司马天星用腾空剑吸尽了二十一名主犯、三百二十名重犯的精气，而后将尸体丢入水眼中。
之后，司马天星命令金光尔率这十四艘船加速前行，去和萧天明、冯良玉、彭飞龙、郑拓、张空等人汇合，并叫他告诉萧天明等人，巫阴魁赎命的那四十四船财宝运到鄱阳湖湖口后，交给神洲帮前来接应的解小玉，其余十二船财宝运回神龙帮清点入库。
交待完毕后，司马天星立即招来小莲，乘鹤直奔洞庭湖而去。
太湖的洞庭西山只有易星、种氏兄弟及五十名户舵弟子留下来，控制着吴良才等十四人、朱贡祖等鳄鱼帮受刑者三百七十六人、邬单衣等免于追责者一百一十人。
司马天星为了赶路，中途不停歇，一直飞了六个时辰，于九月二十六日傍晚时分到达了君山。
他立即找到解小玉，叫她派人通知战舵柯三楫、银舵金生水、户舵程子训、刑舵包宜思、君山舵赤炎、斥候舵诸葛羞花、户舵程子训、工舵鲁巧夫等人明天一早议事。
九月二十八日清晨，司马天星通报了剿灭太湖鳄鱼帮的情况：不伤一兵一卒，鳄鱼帮土崩瓦解，处死恶贯满盈者三百四十一人，受双肢刖刑二百七十八人，受单肢刖刑九十八人，免罪一百一拾人，收缴财宝五十六船，价值在一百二十万两左右。
神州帮众舵主无不振奋，拍手称快。
司马天星命令解小玉亲自带队，率战舵、刑舵、户舵四百四十人，混编成四十四个小队，每小队负责一只快船，立即前往鄱阳湖湖口，等候神龙帮运输财宝的船队。神龙帮运输财宝的船队到后，直接换船，将四十四艘财宝船开回神州帮，清点入库。
命令下达后，司马天星立即骑鹤赶往长江下游，当天深夜到达润州（今镇江）一带。
九月二十九日上午，神龙帮近八百人驾驶着约六十艘快船，到达润州进入长江，溯江而上。司马天星骑鹤去到江中，与萧天明汇合。
对于太湖的善后事宜，两人进行了长时间探讨。最后决定，还是要将太湖接管，如果放任不管，难免会被其他恶势力占据，甚至会随着时间的推移，自发诞生新的恶势力